Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZP3

Pnkd, Probable hydrolase PNKD, mousemouse

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnkdQ69ZP3 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PnkdQ69ZP3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms