Protein–RNA interactions for Protein: Q689Z5

Sbno1, Protein strawberry notch homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno1Q689Z5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
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Sbno1Q689Z5 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sbno1Q689Z5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sbno1Q689Z5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms