Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Top2bQ64511 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Top2bQ64511 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms