Protein–RNA interactions for Protein: Q64336

Tbr1, T-box brain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbr1Q64336 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tbr1Q64336 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms