Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Ift52Q62559 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms