Protein–RNA interactions for Protein: Q62472

Lcn4, Vomeronasal secretory protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn4Q62472 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lcn4Q62472 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lcn4Q62472 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms