Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Sp4Q62445 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Sp4Q62445 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms