Protein–RNA interactions for Protein: Q62311

Taf6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf6Q62311 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Taf6Q62311 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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Taf6Q62311 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf6Q62311 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf6Q62311 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Taf6Q62311 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Taf6Q62311 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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