Protein–RNA interactions for Protein: Q62074

Prkci, Protein kinase C iota type, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkciQ62074 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PrkciQ62074 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PrkciQ62074 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms