Protein–RNA interactions for Protein: Q61937

Npm1, Nucleophosmin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm1Q61937 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Npm1Q61937 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Npm1Q61937 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms