Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Itga6Q61739 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms