Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli3Q61602 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli3Q61602 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli3Q61602 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gli3Q61602 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gli3Q61602 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.2 ms