Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cd53Q61451 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cd53Q61451 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cd53Q61451 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cd53Q61451 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Cd53Q61451 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Cd53Q61451 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
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Cd53Q61451 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cd53Q61451 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cd53Q61451 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cd53Q61451 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cd53Q61451 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cd53Q61451 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Cd53Q61451 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Cd53Q61451 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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