Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

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Length 456 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
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Foxd1Q61345 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Foxd1Q61345 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
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