Protein–RNA interactions for Protein: Q61301

Ctnna2, Catenin alpha-2, mousemouse

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Length 953 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna2Q61301 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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Ctnna2Q61301 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ctnna2Q61301 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ctnna2Q61301 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms