Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Ift20Q61025 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ift20Q61025 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms