Protein–RNA interactions for Protein: Q61003

Cd6, T-cell differentiation antigen CD6, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd6Q61003 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd6Q61003 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cd6Q61003 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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