Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Rbbp4Q60972 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Rbbp4Q60972 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms