Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Grik1Q60934 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Grik1Q60934 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms