Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Neurod1Q60867 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Neurod1Q60867 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms