Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

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Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Slc6a4Q60857 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Slc6a4Q60857 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Slc6a4Q60857 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Slc6a4Q60857 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slc6a4Q60857 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc6a4Q60857 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc6a4Q60857 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Slc6a4Q60857 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Slc6a4Q60857 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Slc6a4Q60857 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
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Slc6a4Q60857 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc6a4Q60857 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms