Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ItgaeQ60677 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms