Protein–RNA interactions for Protein: Q5XF89

Atp13a3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp13a3Q5XF89 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Atp13a3Q5XF89 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Atp13a3Q5XF89 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms