Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Tdrd5Q5VCS6 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tdrd5Q5VCS6 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tdrd5Q5VCS6 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms