Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV85

Synrg, Synergin gamma, mousemouse

Predictions only

Length 1,306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynrgQ5SV85 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SynrgQ5SV85 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms