Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ccdc42Q5SV66 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc42Q5SV66 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms