Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSW2

Psme4, Proteasome activator complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme4Q5SSW2 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Psme4Q5SSW2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms