Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Sft2d1Q5SSN7 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms