Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPL2

Phf12, PHD finger protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf12Q5SPL2 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 2210412B16Rik-201ENSMUST00000201281 498 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Phf12Q5SPL2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms