Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Sumo3-201ENSMUST00000020501 2630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RilpQ5ND29 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms