Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Trappc1Q5NCF2 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
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Trappc1Q5NCF2 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Trappc1Q5NCF2 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms