Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Vps41Q5KU39 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms