Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8B9

Frem3, FRAS1-related extracellular matrix protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frem3Q5H8B9 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Frem3Q5H8B9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Frem3Q5H8B9 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Frem3Q5H8B9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Frem3Q5H8B9 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Frem3Q5H8B9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frem3Q5H8B9 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frem3Q5H8B9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frem3Q5H8B9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frem3Q5H8B9 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frem3Q5H8B9 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frem3Q5H8B9 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Frem3Q5H8B9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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