Protein–RNA interactions for Protein: Q5FW85

Ecm2, Extracellular matrix protein 2, mousemouse

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Length 670 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm2Q5FW85 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ecm2Q5FW85 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm13994-201ENSMUST00000137397 513 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 1700037C18Rik-205ENSMUST00000177323 915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Ecm2Q5FW85 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms