Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Znf354cQ571J5 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms