Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 AC131777.1-201ENSMUST00000214749 387 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Saraf-201ENSMUST00000033933 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Znf608Q56A10 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm38241-201ENSMUST00000192641 898 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Znf608Q56A10 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms