Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lrig2Q52KR2 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lrig2Q52KR2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms