Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Spire1Q52KF3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms