Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Rhox3aQ4TU90 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Rhox3aQ4TU90 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms