Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDG0

Slc27a5, Bile acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a5Q4LDG0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm15904-201ENSMUST00000154515 487 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 1700029E06Rik-201ENSMUST00000189036 757 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm9723-201ENSMUST00000192100 457 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm10046-201ENSMUST00000208208 632 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 3100002H09Rik-201ENSMUST00000053604 873 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 5930422O12Rik-201ENSMUST00000059351 840 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Slc27a5Q4LDG0 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms