Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm5935Q497S0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms