Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx25Q3ZT31 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Snx25Q3ZT31 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Snx25Q3ZT31 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx25Q3ZT31 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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