Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZA1

Rcsd1, CapZ-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcsd1Q3UZA1 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Rcsd1Q3UZA1 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcsd1Q3UZA1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcsd1Q3UZA1 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcsd1Q3UZA1 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcsd1Q3UZA1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcsd1Q3UZA1 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rcsd1Q3UZA1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms