Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rnpc3Q3UZ01 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms