Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV66

Slfn4, Schlafen 4, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn4Q3UV66 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slfn4Q3UV66 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Slfn4Q3UV66 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms