Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV31

Rnf223, RING finger protein 223, mousemouse

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Length 285 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf223Q3UV31 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rnf223Q3UV31 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Lmo3-206ENSMUST00000163024 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rnf223Q3UV31 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf223Q3UV31 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf223Q3UV31 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf223Q3UV31 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf223Q3UV31 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Rnf223Q3UV31 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rnf223Q3UV31 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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