Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.82□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms