Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPL0

Sec31a, Protein transport protein Sec31A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec31aQ3UPL0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sec31aQ3UPL0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms