Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPH7

Arhgef40, Rho guanine nucleotide exchange factor 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef40Q3UPH7 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Arhgef40Q3UPH7 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Commd6-203ENSMUST00000168587 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
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Arhgef40Q3UPH7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Arhgef40Q3UPH7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
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Arhgef40Q3UPH7 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Arhgef40Q3UPH7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
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Arhgef40Q3UPH7 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Arhgef40Q3UPH7 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms