Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Skap2Q3UND0 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Skap2Q3UND0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms